碘缺乏地区精神发育迟滞易感基因的研究
发布时间:2020-06-19 11:21
【摘要】:碘缺乏是世界范围内可预防的精神发育迟滞的一个主要病因。但并不是碘缺 乏地区中的每一个人都会患病,而且碘缺乏地区的精神发育迟滞具有明显的家族 聚集性。这都表明遗传因素可能占有很重要的地位。 甲状腺激素在妊娠期和新生儿早期的脑发育过程中扮演着很重要的角色,脑 中Ⅱ型脱碘酶的主要作用是将甲状腺原素T4转化为活性的甲状腺激素T3和非活性 的逆T3。为了研究Ⅱ型脱碘酶基因(DIO2)可能的遗传作用,我们选择DIO2基因 中3个处于完全连锁不平衡的常见SNPs(rs225014, rs225012 and rs225010)进 行病例对照研究。单位点分析的结果表明,连续的两个SNPs rs225012 和 rs225010都得到了显著性的结果,特别是rs225012 TT 的基因型频率在MR组中的 频率显著性的高于对照组中的频率(X2=9.18, P= 0.00246)。单倍型分析的结果 表明,由rs225012 和 rs225010 组成的单倍型频率的分布在MR组和对照组之间 发现了更为显著性的不同(X2= 15.04, df =2,global P value= 0.000549), 经过基于错误发现率基础之上的多重检验的校正,这个结果仍然具有显著性 (q values = 0.00011)。通过生物信息学分析我们并没有发现这两个SNPs处于剪切 位点附近,另外一种可能是rs225012 和rs225010以及由它们组成的单倍型和附 近的一个功能性的致病基因处于连锁不平衡。 在 DIO2 基因附近有两个候选基因,位于上游的 TITF1 基因(甲状腺转录因 子 1)和 位于上游的 TSHR 基因(促甲状腺激素受体)。但病例对照研究中 TITF1 基因中的两个 SNP 和 TSHR 基因中的四个 SNPs 无论是在单位点还是单倍型分析 中都没有得到显著性的关联结果。 上述的研究结果结合 DIO2 基因在脑发育过程当中的重要作用,我们认为 DIO2 基因可能通过影响脑部 T3的量和碘缺乏的自然环境共同导致了部分精神发 育迟滞的发生。
【学位授予单位】:中国科学院研究生院(上海生命科学研究院)
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2004
【分类号】:R394
【图文】:
点的状态的组合。我们知道,每个多态性位点中的两个等位基因分别来自于父亲和母亲,单倍型实际上应该是单倍体中的基因型(Haploid Genotype)。对于我们常用的基因分型的方法,我们只能分清楚单个多态性位点的基因型,但对于如图1-2 所示的多杂合子的 SNP 分型结果,假设 m 个杂合子 SNP,那么它们可能的在染色体上的组合就有 2m-1种所谓的“相”(phase),到底在这个个体中它是由哪两种“相”组成的,就很难从 SNP 分型的结果推知了。单个遗传标记进行遗传分析的效力较小,由几个连锁位点组成的单倍型则能提供更多更可靠的信息,而且用单倍型来检测连锁不平衡常常比单位点更可靠。这可以从下面对某个区域两位点间和单倍型间 LD 程度的作图看出:如果以单倍型为多态性的单位,连锁不平衡随距离的增加而单调下降(图 1-3b),而如果用两个位点之间的 D′值来指示连锁不平衡程度随距离的改变,得到的却是较为杂乱的图形(图 1-3a)。39另外,单倍型分析还可以减少基因型-表型比较的次数,并提高一些复杂分析方法的效力,因此在现在的关联分析中被普遍使用。
3之间的脱碘互相转化等步骤(图 3-1)。图3-1 甲状腺激素的合成4.甲状腺激素的生理作用T4与 T3都具有生理作用。由于 T4在外周组织中可转化为 T3,而且 T3的活性较大,曾使人认为 T4可能是 T3激素原,T4只有通过 T3才有作用。目前认为,T4不仅可作为 T3的激素原,而且其本身也具有激素作用,约占全部甲状腺激素作用的 35%左右。在甲状腺激素作用的细胞核受体上,既存在 T3结合位点,也有 T4结合位点
本文编号:2720717
【学位授予单位】:中国科学院研究生院(上海生命科学研究院)
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2004
【分类号】:R394
【图文】:
点的状态的组合。我们知道,每个多态性位点中的两个等位基因分别来自于父亲和母亲,单倍型实际上应该是单倍体中的基因型(Haploid Genotype)。对于我们常用的基因分型的方法,我们只能分清楚单个多态性位点的基因型,但对于如图1-2 所示的多杂合子的 SNP 分型结果,假设 m 个杂合子 SNP,那么它们可能的在染色体上的组合就有 2m-1种所谓的“相”(phase),到底在这个个体中它是由哪两种“相”组成的,就很难从 SNP 分型的结果推知了。单个遗传标记进行遗传分析的效力较小,由几个连锁位点组成的单倍型则能提供更多更可靠的信息,而且用单倍型来检测连锁不平衡常常比单位点更可靠。这可以从下面对某个区域两位点间和单倍型间 LD 程度的作图看出:如果以单倍型为多态性的单位,连锁不平衡随距离的增加而单调下降(图 1-3b),而如果用两个位点之间的 D′值来指示连锁不平衡程度随距离的改变,得到的却是较为杂乱的图形(图 1-3a)。39另外,单倍型分析还可以减少基因型-表型比较的次数,并提高一些复杂分析方法的效力,因此在现在的关联分析中被普遍使用。
3之间的脱碘互相转化等步骤(图 3-1)。图3-1 甲状腺激素的合成4.甲状腺激素的生理作用T4与 T3都具有生理作用。由于 T4在外周组织中可转化为 T3,而且 T3的活性较大,曾使人认为 T4可能是 T3激素原,T4只有通过 T3才有作用。目前认为,T4不仅可作为 T3的激素原,而且其本身也具有激素作用,约占全部甲状腺激素作用的 35%左右。在甲状腺激素作用的细胞核受体上,既存在 T3结合位点,也有 T4结合位点
【引证文献】
相关硕士学位论文 前2条
1 王廷曦;PAK3、RAC1基因多态性与秦巴山区儿童精神发育迟滞相关性研究[D];西北大学;2007年
2 代玲;FTSJ1基因多态性与秦巴山区儿童精神发育迟滞的相关性研究[D];西北大学;2008年
本文编号:2720717
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/shiyanyixue/2720717.html
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