杭州地区伤寒及甲型副伤寒沙门菌流行菌株分子特征的研究

发布时间：2020-06-28 04:00

【摘要】：目的伤寒、甲型副伤寒是一种急性消化道传染病,传染源为病人及带菌者,传播途径主要为粪-口传播,人群普遍易感。其病原体为伤寒沙门菌及甲型副伤寒沙门菌。近年来杭州地区发生了多起伤寒、甲型副伤寒的暴发与流行,已成为严重的公共卫生问题。本课题旨在通过研究2002～2008年杭州地区伤寒沙门菌、甲型副伤寒沙门菌优势菌株的分子特征,为传染源的溯源提供实验室线索,为有效地干预控制伤寒、甲型副伤寒的发生提供依据。 方法1.采用脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)、多位点串联重复序列分析(MLVA)、多位点序列分型(MLST)三种分型方法对杭州地区31株伤寒沙门菌进行分子分型,并进行药敏试验。2.对杭州地区2002-2008年分离到的404株甲型副伤寒沙门菌进行PFGE分型和药敏试验。3.将八株非伤寒沙门菌应用与伤寒沙门菌一致的扩增条件在TR1、TR2、TR3、Sa102这4个位点进行PCR。4.应用PFGE和MLST方法对生化、血清鉴定有分歧的沙门菌进行鉴定。 结果1.131株伤寒沙门菌可分为14个PFGE型,28个MLVA型,3个MLST型,6个耐药型；31株伤寒沙门菌在TR1、TR2、TR3、Sa102这4个VNTR位点表现出多态性,在其余18个VNTR位点均未表现出多态性；3个MLST型中ST1型7株,ST2型23株,ST3型1株。1.22株在TR3位点重复序列拷贝数为2.3的伤寒沙门菌在TR3位点重复序列的5’上游的侧翼序列分别有61bp(重复序列的5’上游的侧翼序列53-113bp)和340bp(重复序列的5’上游的侧翼序列1-340bp)的碱基缺失导致TR3位点扩增的目的片段的大小与串联重复序列的拷贝数不呈正相关。2404株甲型副伤寒沙门菌可分为6个PFGE型和4个耐药型,P1型和P2型属于同一个克隆系,该克隆系菌株占试验菌株数的99%,分离自临安市的310株菌均为P1型,分离自西湖区的主要菌型是P2型和P1型。3八株非伤寒、甲型副伤寒沙门菌在TR1、TR2、TR3、Sa102这四个位点均未表现出多态性。4三株生化、血清鉴定有分歧的沙门菌PFGE图谱与肠炎沙门菌标准株CMCC10022比较分别只有4条和2条条带的差异,与甲型副伤寒沙门菌标准株CMCC50001的图谱完全不同。三株菌与肠炎沙门菌标准株CMCC10022的MLST型别均为ST11型,在MLST数据库中,该型的菌株均为肠炎沙门菌,甲型副伤寒沙门菌标准株CMCC50001的MLST型别为ST85型。 结论近年杭州地区甲型副伤寒疫情由同一克隆系菌株感染所致,但本地区流行的伤寒沙门菌株呈现高度多样性。呈高度多态性的可变串联重复序列(VNTR)位点TR1、TR2、Sa102可作为本地区伤寒沙门菌株的检测标志。可以利用分子分型技术来协助鉴定通过表型鉴定难以区分的沙门菌。
【学位授予单位】：浙江大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：R378.22

【参考文献】

相关期刊论文 前6条

1 闫梅英,梁未丽,李伟,阚飙;1995-2004年全国伤寒副伤寒的流行分析[J];疾病监测;2005年08期

2 鲍倡俊,庄菱,宋俐,张雪峰,李孝风;江苏省2001年～2003年伤寒副伤寒监测及流行病学分析[J];江苏预防医学;2004年04期

3 杨进,董柏青,王鸣柳,唐振柱,龚健,李翠云,曾竣,杨宏徽;1994～2002年广西甲型副伤寒和伤寒流行情况分析[J];中国热带医学;2004年02期

4 储从家;孔繁林;吴惠玲;李杰芬;;3888例甲型副伤寒流行病学调查[J];云南医药;2008年01期

5 汪皓秋;潘劲草;孟冬梅;张蔚;孙昼;;杭州甲型副伤寒分离菌株脉冲场凝胶电泳分型[J];中国公共卫生;2007年03期

6 秦淑文;陈恩富;谢淑云;柴程良;余昭;莫顺堂;韦余东;吕华坤;;浙江省1997~2006年伤寒副伤寒流行特征分析[J];浙江预防医学;2008年05期

本文编号：2732526