南京市2012年-2013年肠道病毒71型分离株VP1基因特性分析

发布时间：2017-06-20 15:08

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【摘要】：目的了解南京地区肠道病毒71型流行株的遗传学背景。方法采集2012年-2013年手足口病患者咽拭子样本,经特异性逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)鉴定EV71病毒核酸阳性者进行细胞接种分离病毒。选取阳性分离株扩增其VP1完整编码区全长基因并进行序列测定,利用生物信息学软件对序列加以分析,构建序列遗传亲缘关系树。结果共分离得到14株EV71毒株,经VP1全长基因测序分析发现,所分离病毒VP1区核苷酸与EV71病毒A型代表株同源性为79.6%~81.3%,与B型代表株的同源性为81.7%~84.7%,而与C型代表株的同源性明显较高,为86.0%~95.2%,其中与C4代表株(AY895144)的同源性最高,为93.8%~95.2%。进化树分析发现本地流行株与上海、安徽等地区流行株的亲缘较近,而与台湾地区流行株亲缘较远。相应的氨基酸位点分析也表明符合C基因型的氨基酸模式。结论南京地区2012年-2013年肠道病毒71型的流行株主要为C4亚型,与上海和安徽地区流行株亲缘较近,可能具有同一来源。
【作者单位】： 南京市疾病预防控制中心;
【关键词】： 肠道病毒型 手足口病 外壳蛋白VP 基因型
【基金】：南京市医学科技发展专项资金(YKK11052)
【分类号】：R373.25
【正文快照】： 肠道病毒71型(EV71)是小RNA病毒科肠道病毒属成员,其感染主要引起手足口病(HFMD)。手足口病是一类急性传染病,主要表现为发热和手、足、口腔及臀部等部位的皮疹及溃疡,个别患者甚至会出现较为严重的并发症,如无菌性脑炎、脑膜炎、肺水肿等[1]。自1969年EV71病毒首次从美国加利

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本文编号：466000