2014年安徽省柯萨奇病毒A组16型分离株VP1基因特征研究

发布时间：2017-06-22 21:11

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【摘要】：研究2014年安徽省手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)患儿中分离的柯萨奇病毒A组16型(Coxsachivirus A 16,CVA16)毒株VP1区基因特征。收集安徽省2014年1月至11月期间413份HFMD患儿咽拭子标本接种敏感细胞分离肠道病毒,用荧光定量RT-PCR鉴定细胞培养物,对CVA16阳性培养物进行毒株VP1区RT-PCR扩增及核苷酸序列测定和基因特征分析,并与国内外参考序列构建基因亲缘性关系树。共分离鉴定出肠道病毒阳性培养物97份,其中CVA16病毒分离株17株,人肠道病毒71型(Human enterovirus 71,HEV71)分离株76株,其它肠道病毒分离株4株,总体病毒分离率为23.49%(97/413)。CVA16基因亲缘性关系分析显示:安徽省2014分离的17株CVA16毒株都属于B1基因型B1b一个分支,它们之间在核苷酸和氨基酸水平上的同源性分布为分别为95.30%~100%和98.70%~100%,但在B1b分支内形成几个传播链。17株CVA16毒株VP1区核苷酸序列与国内云南、湖南、广东、西藏和江苏地区病毒分离株同源性较高,亲缘性关系近,其中与湖南2013年和广东深圳2014年CVA16病毒分离株同源性最高,为96.40%~99.70%。2014年安徽省分离的CVA16病毒分离株属于B1基因型B1b亚型,为优势流行株;在B1b分支内形成多个小的病毒传播链共同流行。
【作者单位】： 安徽省疾病预防控制中心;安徽医科大学公共卫生学院;
【关键词】： 柯萨奇病毒A组型 手足口病 VP基因 B基因型
【分类号】：R373.2
【正文快照】： 手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)是一种在儿童中常见的传染病,尤其对5岁以下幼儿易感,柯萨奇病毒A组16型(Coxsack-ievirus A16,CVA16)和人肠道病毒71型(Humanenterovirus 71,HEV71)已被证实为HFMD的两种主要病原体[1-2]。自2008年安徽阜阳HFMD大规模暴发以来,有文

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