DNA甲基化与广西巴马地区长寿的相关性
本文关键词:DNA甲基化与广西巴马地区长寿的相关性
【摘要】:目的探讨DNA甲基化与巴马长寿的关系。方法在广西巴马县长寿家族中选取60例90~110岁老人组成长寿组,在非长寿家族中选取48~85岁的健康者60例组成对照组。抽取外周血2 ml,构建DNA混合池,利用Roche-Nimble Gen甲基化芯片技术对研究人群的全基因组进行扫描,使用SPSS17.0软件及在线分子功能注释系统(MAS)进行数据分析,P0.01视为甲基化程度较高的序列。结果共筛查出6 441个超甲基化位点,其中长寿组392个,对照组6 049个。高甲基化位点共涉及1 618个基因,长寿组有133个,对照组有1 485个。两组人群的高甲基化基因均涉及24个生物学功能,均以细胞过程、生理过程、生物调控为主。长寿组高甲基化基因涉及42个信号通路,对照组涉及156个信号通路。长寿组和对照组中均有与年龄相关性疾病有关联的高甲基化基因,长寿组中涉及较多疾病的基因有CCKBR、COL18A1、EGR3、H19、IL11、TIMP1、S100A1等;对照组中涉及较多疾病的基因有ACSL1、ADAMTS13、ADCY8、AHRR、ARVCF、ATP2A1、ATP5I、BCS1L、GCK、ITGA2B等。结论本研究利用芯片技术筛查获得了与长寿呈正相关和负相关的高甲基化位点、基因及其生物学功能分类、信号通路,为DNA甲基化和长寿的深入研究提供了基础数据。
【作者单位】: 广西医科大学公共卫生学院;广西检验检疫局;广西疾病预防控制中心;广西医科大学医学科学实验中心;
【关键词】: DNA混合池 DNA甲基化 巴马 长寿
【基金】:国家自然科学基金(81260423,81060246) 广西自然科学基金重点项目(2011GXNSED018029) 2012年优秀博士学位论文培育项目(YCBZ2012012)
【分类号】:R394
【正文快照】: 广西巴马县是长寿之乡,本课题组之前曾探讨过DNA甲基化水平与巴马长寿的相关性,发现巴马人群和对照组的总体甲基化水平都呈增龄性下降,年龄与甲基化比值呈负相关,巴马县人群的DNA总体甲基化水平比对照组人群高,提示巴马长寿现象可能与该地区人群较高的DNA总体甲基化水平有关〔
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,本文编号:515401
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