云南省猪戊型肝炎病毒全基因组扩增及进化分析

发布时间：2017-07-15 21:33

  本文关键词：云南省猪戊型肝炎病毒全基因组扩增及进化分析

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【摘要】：目的对猪戊型肝炎病毒全长基因组进行扩增,分析其进化关系,为HEV的感染性克隆研究奠定基础。方法利用巢式逆转录聚合酶链反应(RT-nPCR)和RACE技术对猪粪便中HEV样品进行全基因组扩增,利用DNAStar和MEGA4.0软件进行同源性比较和进化树分析。结果 RT-nPCR方法扩增出HEV的5段目的基因序列和RACE技术扩增出HEV的5′和3′端,序列比对结果正确,HEV全长扩增成功。同源性分析显示其与新疆株(GU119961)同源性较高(96.1%)。系统进化树显示该病毒属于基因4型h亚型猪HEV。结论 HEV全基因组序列扩增成功,为深入研究HEV奠定基础。
【作者单位】： 昆明理工大学医学院;
【关键词】： 猪戊型肝炎病毒 巢式逆转录PCR 全长基因组分析
【基金】：国家自然科学基金资助(No.31360619) 云南省自然科学基金(No.2013FB032,2011FZ068) 中国博士后科学基金(No.2014M562672)资助,杨臣臣和龙飞燕同等贡献~~
【分类号】：R373
【正文快照】： (Medical Faculty,Kunming University of Science and Technology,Kunming650500,China)戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV),是一种经肠道传播,严重危害人类健康的病毒性肝炎病原体[1]。HEV主要经过粪-口途径传播,食用HEV污染的水源和食物是导致HEV暴发流行的主要原因[2-3]

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前3条

1 李文贵;佘锐萍;李睿文;舒相华;丁叶;岳卓;;昆明屠宰猪戊型肝炎病毒感染情况的调查[J];中国兽医科学;2010年06期

2 梁靖瑞;韦献飞;薛城;吉彦莉;马亚琪;唐荣兰;朱永红;庄辉;;猪HEV基因型和亚型的研究[J];中华微生物学和免疫学杂志;2007年08期

3 黄芬;禹文海;马天武;井申荣;曾韦锟;;云南某农村猪戊型肝炎病毒分子流行病学调查[J];中国人兽共患病学报;2012年03期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前8条

1 李文贵;段新慧;张佳;严红亚;;戊型肝炎病毒感染模型研究进展[J];动物医学进展;2014年06期

2 周泽伟;唐启明;;重庆某地戊型肝炎的临床特点[J];检验医学与临床;2014年19期

3 刘利强;王辉;杜娟;宋慧月;李海芹;佘锐萍;;屠宰猪肝脏的纤维化检测[J];肉类研究;2012年03期

4 付红伟;杜刚;朱永红;李凌君;王玲;耿家宝;薛城;王晓娟;庄辉;;新疆猪戊型肝炎病毒株CHN-XJ-SW33全基因组序列分析[J];中国预防医学杂志;2010年05期

5 胡凤姣;李s，

本文编号：545893