南京地区2012～2013年G9型轮状病毒VP7基因特征的分析
本文关键词：南京地区2012～2013年G9型轮状病毒VP7基因特征的分析
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【摘要】：A组轮状病毒是引起成人和婴幼儿急性腹泻的主要病原。了解轮状病毒流行株的型别,对主要中和抗原VP7的编码基因进行遗传变异分析,可为当地轮状病毒疫苗的应用和开发提供指导。我们对2012年10月至2013年12月南京地区908例腹泻门诊患者的粪便标本进行轮状病毒检测,采用RT-PCR方法对随机抽取的50份阳性标本进行G分型,并对其中19份G9型轮状病毒的VP7基因序列测序分析。结果发现轮状病毒阳性率11.34%(103/908),其中以G9型为主,占78.0%(39/50),其次是G2、G1和G3型。对G9型轮状病毒VP7基因核苷酸序列进行分析,显示主要分为G9-VI亚型和G9-III亚型,以G9-VI亚型为主,且属于中国和日本G9型轮状病毒亚簇,部分毒株在A、B、C、F四个中和抗原表位中有变异,这可能有助于G9型轮状病毒的流行,值得引起注意。
【作者单位】： 南京市疾病预防控制中心;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所;
【关键词】： 轮状病毒G型 RT-PCR VP基因 遗传变异
【基金】：南京市卫生局十二五重大专项第6项 南京市医学科技发展项目(QRX11039)
【分类号】：R373.2
【正文快照】： A组轮状病毒(Group A rotavirus,GARV)近30年来被认为是婴幼儿急性腹泻最常见的病因。GARV感染广泛,每年引起全世界大约453 000名5岁以下婴幼儿的死亡,给全球带来巨大的经济负担[1-2]。GARV基因组编码6种结构蛋白(VP1~VP4,VP6和VP7)和6种非结构蛋白(NSP1~NSP6)。外部衣壳由VP4
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