以多肽组分特异性和GC含量分类细菌的有效性分析

发布时间：2017-08-20 03:21

  本文关键词：以多肽组分特异性和GC含量分类细菌的有效性分析

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【摘要】：本文研究了细菌的蛋白质多肽组分统计特征与基因组GC(Guanine+Cytosine)含量的相关性,发现当多肽长度较小时多肽组分特异性与GC含量存在着很强的关联;随着多肽长度增加,上述关联发生突变,关联迅速丧失.这一结果表明,基于组分特异性确定细菌亲缘关系的方法的确给出了不同于GC含量的信息,从而能实现有效分类.
【作者单位】： 陕西师范大学物理学与信息技术学院;厦门大学物理系;
【关键词】： 种系基因组学 非序列比对 多肽组分矢量 GC含量
【基金】：国家自然科学基金(批准号:11147020) 中央高校基本科研业务费专项资金(编号:GK201102028)资助项目
【分类号】：R394
【正文快照】： 引用格式:李静珂,金涛,赵鸿.以多肽组分特异性和GC含量分类细菌的有效性分析.中国科学:物理学力学天文学,2015,45:050501Li J K,Jin T,Zhao H.Validity of peptide composition and GC-content for classifying bacteria(in Chinese).Sci Sin-Phys Mech Astron,2015,45:*联系

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本文编号：704392