细胞信号转导网络的全局灵敏度分析

发布时间：2017-08-21 23:13

  本文关键词：细胞信号转导网络的全局灵敏度分析

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【摘要】：灵敏度分析是定性定量研究系统生物学模型不确定性的主要方法,可以有效确定主导参数,减小模型不确定性,提高优化效率。然而如何快速有效地评估参数灵敏度现已成为系统生物学模型优化的难题。针对传统的全局灵敏度方法对多参数复杂系统生物学模型分析的不足,采用Kriging代理模型法,结合改进的基于方差的Sobol法,建立采用代理模型法的Sobol定量全局灵敏度分析法,实现复杂模型参数灵敏度分析的快速定量化评估。选用基于Smad蛋白的TGF-B信号转导网络进行实例研究,以细胞核内磷酸化Smad复合物为目标函数评价模拟效果。研究表明,上述方法在实现定量全局灵敏度分析的同时降低了模型运行时耗,提高模型评估效率,且与传统Sobol法具有同样的评估效果。
【作者单位】： 华东理工大学信息科学与工程学院;
【关键词】： 代理模型 全局灵敏度 细胞信号转导网络
【基金】：国家自然科学基金(61304071)
【分类号】：R329.2
【正文快照】： 1引言 生物系统通常由大量相互作用成分构成,并包括空间,时间和生物学尺度下的各种运作流程[I]U]。系统生物学主要工作是整合不同层次信息以理解生物系统如何行使功能并最终能够建立整个系统的可理解模型⑴。 建立生物系统数学或计算机模型的主要困难是参数值的准确估计[4]。

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本文编号：715677