2012年江苏省柯萨奇病毒A组14型分离株全基因序列分析

发布时间：2017-08-22 01:25

  本文关键词：2012年江苏省柯萨奇病毒A组14型分离株全基因序列分析

  更多相关文章： 手足口病(HFMD) 柯萨奇病毒A组型(CVA) 基因型

【摘要】：目的探讨2012年江苏省手足口病(HFMD)病原体CVA14病毒的全基因序列特点。方法采集江苏省邳州市2012年HFMD患儿的咽拭子或肛拭子样本,分离培养得到2株CVA14病毒,利用RT-PCR扩增CVA14全长基因。利用DNAStar软件包的Meg Align进行核苷酸序列分析,构建系统进化树。结果扩增得到覆盖CVA14全基因组的3个片段,拼接后为CVA14全基因组,分别命名为PZ05Y/JS/2012和PZ15G/JS/2012。同源性分析结果显示,这2株分离株之间同源性为99.4%,原型株(G-14)的核苷酸同源性为84.4%。进化树结果显示,所有的CVA14形成A、B和C共3个分支。结论获得了江苏省CVA14的全基因序列,分析了该毒株的进化特点,补充了中国CVA14病毒的基因信息。
【作者单位】： 中国食品药品检定研究院肝炎病毒疫苗室;江苏省疾病预防控制中心;
【关键词】： 手足口病(HFMD) 柯萨奇病毒A组型(CVA) 基因型
【基金】：科技部重大专项(2013ZX09304101)
【分类号】：R373.23
【正文快照】： 柯萨奇病毒A组14型(Coxsackievirus A14,CVA14)属于小RNA病毒科肠道病毒属。CVA14最早的分离株G14为1950年分离[1]。CVA14基因组是大小为7.4×103bp的单股正链RNA,由5'非编码区(5'-NTR)、编码区、3'非编码区(3'-NTR)和一个poly(A)尾部分组成。编码区可分为P1、P2和P3区,其中P1

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 吴永忠;黄永辉;盛学梅;;重症手足口病患儿早期临床表现及高危因素分析[J];临床医学;2014年02期

2 王佶;徐子乾;张晨;牛培华;关丽;段招军;马学军;;一种基于新型再测序芯片的不明原因腹泻样品检测方法的建立和初步应用[J];病毒学报;2014年02期

3 李岩;韩光跃;刘艳芳;刘兰芬;李琦;齐顺祥;;2011年石家庄地区流感样病例病毒检测研究[J];病毒学报;2014年04期

4 沈世富;;蓝芩口服液联合康复新液治疗小儿手足口病的疗效分析[J];河北医药;2013年19期

5 朱琥;韩晓群;;2012年武汉地区手足口病肠道病毒分型与临床特征分析[J];武汉大学学报(医学版);2014年04期

6 宋春兰;郭燕军;成怡冰;金志鹏;陈丹;顾雪;李志;;合并神经损害的危重型手足口病患儿临床特征及预后分析[J];郑州大学学报(医学版);2015年01期

7 夏青娟;李树林;孟凡东;赵淑杰;徐晓霞;惠琪;刘令九;;抗甲型肝炎病毒卵黄免疫球蛋白的制备及应用[J];中国生物制品学杂志;2013年12期

8 王继麟;陈晓琦;吴杰;明平刚;宰家敏;郭长福;杨京生;段凯;;高效价抗肠道病毒71型兔血清的制备及鉴定[J];中国生物制品学杂志;2014年05期

9 姚相杰;何雅青;蔡春林;罗敏;杨洪;冼慧霞;张海龙;;2011-2012年深圳市重症手足口病的病原学和流行病学分析[J];热带医学杂志;2014年08期

10 韩树生;王健;吴娜;迟新宇;;大剂量短疗程静脉滴注人免疫球蛋白治疗重症手足口病51例[J];中国药业;2013年17期

中国博士学位论文全文数据库 前8条

1 邓军霞;靶向5’UTR的化学修饰siRNAs抑制肠道病毒71型感染的研究[D];第四军医大学;2013年

2 王晓雯;高致病小RNA病毒病毒样颗粒的制备及部分颗粒的免疫研究[D];北京工业大学;2013年

3 魏振宏;重大病毒性疾病病原体对细胞凋亡的影响及对宿主限制因子拮抗功能的研究[D];吉林大学;2013年

4 李继安;肠道病毒71型感染对小鼠CPT2、PSGL-1和SCARB2的表达和作用的影响[D];青岛大学;2014年

5 周红桃;广东省2009-2013年的手足口病流行病学与临床特征[D];南方医科大学;2014年

6 柳楠;肠道病毒分子流行病学及肠道病毒71型感染致炎症反应机制研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2014年

7 陈思源;维生素A营养对儿童抗手足口病免疫力的影响[D];复旦大学;2013年

8 聂凯;等温扩增技术检测手足口病病原的研究[D];中国疾病预防控制中心;2013年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 袁晓晶;肠道病毒71型分离鉴定及其致病机制的初步探讨[D];山东大学;2013年

2 王冠洲;EV71感染宿主中枢神经系统过程中宿主因子作用的初步探究[D];北京协和医学院;2013年

3 石秀芳;手足口病RT-PCR和FQ-PCR检测方法比较及亳州市流行特征研究[D];安徽医科大学;2013年

4 任庆杰;柯萨奇病毒A组16型分离鉴定及感染C57乳鼠致病模型的研究[D];宁夏医科大学;2013年

5 熊洁;长沙地区住院儿童急性中枢神经系统病毒感染性疾病的病原学分析[D];湖南师范大学;2014年

6 王鑫磊;长春地区手足口病病原学特征及分子分型[D];吉林大学;2014年

7 吴晓忠;核壳型抗EV71免疫球蛋白（IgY）微胶囊的制备及性能研究[D];广东工业大学;2014年

8 李月香;肠道病毒71型串联表位疫苗的分子设计与免疫效果评价[D];安徽医科大学;2014年

9 张磊;干扰素膜蛋白（IFITM）Tet-on系统稳定细胞系的建立及其抗CA16病毒的初步研究[D];河北大学;2014年

10 孙晓英;小儿手足口病重症病例评分法的应用研究[D];浙江大学;2013年

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 ;柯萨奇病毒感染[J];中华护理杂志;1994年05期

2 戴国珍;柯萨奇病毒[J];微生物学通报;1977年04期

3 乐杰,孙舒娴;柯萨奇病毒感染[J];实用妇产科杂志;1998年01期

4 唐佩文;;谈谈柯萨奇病毒[J];健康博览;1997年11期

5 仇慧仙;姜剑斌;陈其;;柯萨奇病毒B感染和细胞内信号传导调控[J];国际病毒学杂志;2006年05期

6 陈宏新,陈洪,陈淑芸,刘晶星;柯萨奇病毒激活ERK信号途径的初步研究[J];上海第二医科大学学报;2004年07期

7 丁关庆;;无孔不入的柯萨奇病毒[J];健康博览;1998年10期

8 方北;什么是柯萨奇病毒?[J];中老年保健;1994年04期

9 彭育才,冯树异;柯萨奇病毒感染的实验室诊断研究进展[J];微生物学通报;1993年02期

10 杨丽;李欣;田朗;黄利华;李卓颖;杨作成;;柯萨奇病毒B3感染HeLa细胞后Bax和Bim的表达[J];中国病理生理杂志;2014年03期

，

本文编号：716285