江苏省2009—2013年汉坦病毒分离株全基因序列测定及分析

发布时间：2017-08-23 11:17

  本文关键词：江苏省2009—2013年汉坦病毒分离株全基因序列测定及分析

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【摘要】：目的:从分子水平分析2009—2013年江苏省分离汉坦病毒(Hantavirus,HV)的型别及变化,为疾病的预防控制提供实验依据。方法:采集2009—2013年江苏省肾综合征出血热(hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)急性期患者血清及监测点鼠肺标本。采用胶体金法检测血清样本中汉坦病毒的Ig M、Ig G抗体,采用免疫荧光检测鼠肺样本中汉坦病毒抗原,并用VERO E6细胞分离病毒,RT-PCR检测标本培养物中病毒M片段以鉴定HV病毒,采用高通量测序技术对分离株进行全基因组测序,MEGA6.0软件对其进行序列比对和进化分析。结果:分离到的11株病毒与陕西分离株LR1、四川分离株S85-46以及汉坦病毒原型株76-118遗传距离最为接近,属于汉滩(Hantean,HTN)型病毒。分离株与2002年分离的江苏(A9、HTN型)株以及浙江株、安徽株处于不同的进化分支上,表明遗传关系较远。结论:江苏的汉坦病毒优势株发生了变化,而且发生了宿主转换。目前疫苗仍具有保护效力,但需加强监测。
【作者单位】： 南京医科大学公共卫生学院;江苏省疾病预防控制中心;
【关键词】： 肾综合征出血热 汉坦病毒 基因组 序列测定 系统发生树
【基金】：江苏省临床医学科技专项(BL2014081) 江苏省科教兴卫工程(ZX201109,RC2011085)
【分类号】：R373
【正文快照】： [Acta Univ Med Nanjing,2015,35(11):1564-1571]汉坦病毒(Hantavirus,HV)属于布尼亚病毒科汉坦病毒属,病毒基因组由3个独立的分段负链RNA组成,即小(S)、中(M)和大(L)片段,它们分别编码核衣壳蛋白(nucleocapsid protein,NP)、包膜糖蛋白(G1/G2 glycoprotein)和病毒RNA依赖的RN

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本文编号：724717