云南新分离四株流行性乙型脑炎病毒全基因组序列特征研究

发布时间：2017-08-28 12:45

  本文关键词：云南新分离四株流行性乙型脑炎病毒全基因组序列特征研究

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【摘要】：目的对云南省2009年和2010年分离的4株流行性乙型脑炎(乙脑)病毒进行全基因组序列测定和分析,阐明近期乙脑病毒流行株的分子生物学特征及基因型。方法通过反转录-聚合酶链反应和核苷酸序列测定方法获得病毒全基因组序列,采用Clustal X、DNAstar和Mega等生物学软件进行核苷酸和推导氨基酸序列分析及系统进化分析。结果 2009年和2010年在云南省中部和西部地区三带喙库蚊(Culex tritaeriorhynchus)中分离到4株乙脑病毒,其中YN09M57株基因组全长10 967 bp,DH10M865、DH10M978和DHL10M62株基因组全长均为10 965 bp,均编码3432个氨基酸。这4株病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为98.3%~99.9%和99.5%~99.9%,与来自Gen Bank的7株基因Ⅰ型乙脑病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为98.3%~99.9%和99.7%~99.9%;与基因Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ型参考株核苷酸和氨基酸同源性分别在78.7%~89.7%和91.4%~98.4%;与乙脑减毒活疫苗SA14-14-2株在E蛋白编码区有15个氨基酸位点差异,均位于抗原关键位点之外。基于E基因、全基因组系统进化分析显示云南4株乙脑病毒均为基因Ⅰ型,并形成2个进化分支,分别与相邻省份和东南亚流行株进化关系较近。结论云南新分离4株乙脑病毒属基因Ⅰ型,虽然它们之间及其与该型参考株核苷酸和氨基酸位点存在某些差异,但决定病毒毒力和抗原性的关键位点未见明显变化。本研究提示这些乙脑病毒流行株具有稳定的遗传特性和地域特征。
【作者单位】： 云南省地方病防治所/云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室;大理大学公共卫生学院;
【关键词】： 流行性乙型脑炎病毒 全基因组 同源性分析 系统进化分析
【基金】：国家自然科学基金(No.30560142)~~
【分类号】：R373.21
【正文快照】： 流行性乙型脑炎(Janpanese encephalitis,乙脑)是一种蚊媒传播的急性中枢神经系统传染病,主要流行于亚洲及太平洋地区[1]。在我国,几乎所有省(直辖市和自治区)均有本病流行[2]。云南省地处我国西南边境地区,与东南亚诸国接壤,属于热带、亚热带气候,适宜蚊虫和蚊媒病毒传播,乙

【参考文献】

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本文编号：747989