基于tdh1基因变异的大流行副溶血性弧菌鉴别方法的建立

发布时间：2017-09-01 04:37

  本文关键词：基于tdh1基因变异的大流行副溶血性弧菌鉴别方法的建立

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【摘要】：目的基于副溶血性弧菌tdh1 DNA序列中特异性变异位点,建立新的大流行株鉴别方法。方法通过对多种型别菌株的tdh序列进行比对,查找大流行株特异性变异位点,并基于该位点设计位点特异性PCR体系和检测方法。以GS-PCR和tdh基因联合检测为参照方法,用已知大流行株、非大流行株和2014年收集的1 067株副溶血性弧菌对新方法进行验证。结果 3株菌株的6条tdh全序列存在26个多态性位点,其中tdh1基因的第368位碱基的变异[G/A]能用于鉴别大流行株,本研究基于此位点建立了tdh1_368位点特异性PCR。该变异能将1996年后的大流行O3∶K6型菌株与1996前的进行区分,也能将大流行株其他血清型变种与非流行菌株进行区分。对2014年的1 067株菌株的检测结果显示,tdh1_368位点特异性PCR与参考方法检测结果完全一致。结论本研究以副溶血性弧菌tdh基因的多态性位点建立检测大流行菌型的试验方法,从对1 067株菌株的实测结果来看,tdh1_368位点特异性PCR与既往报道的方法具有高度的一致性,且指标更为直接。
【作者单位】： 上海市疾病预防控制中心;
【关键词】： 副溶血性弧菌 tdh PCR 食源性致病菌 鉴别方法
【基金】：国家“十二五”科技国家科技重大专项(2013ZX10004216-001-004)
【分类号】：R378
【正文快照】： 副溶血性弧菌(Vibrio parahaemolyticus,VP)最初发现于1950年的一起食物中毒事件,尽管多种血清型的VP能致人感染,但1996年之后出现的O3∶K6型及其血清型变种被认为是导致世界范围内VP腹泻暴发和流行的主导菌型[1-3]。众多研究者对大流行株的鉴别进行了大量的工作,Matsumoto等[

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本文编号：769957