东南沿海地区汉坦病毒的遗传进化分析

发布时间：2017-09-04 19:28

  本文关键词：东南沿海地区汉坦病毒的遗传进化分析

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【摘要】：目的对浙江、福建省及上海市东南沿海地区汉坦病毒的基因进行比较。方法收集浙江、福建省及上海市汉坦病毒部分M基因序列,应用Mega4.0和DNAStar软件包进行系统发生分析,以邻位相连法(NJ)构建系统发生树,分析东南沿海地区浙江、福建省及上海市汉坦病毒的基因差异,分析采用1000个多序列组。结果经对浙江、福建省及上海市若干株汉坦病毒基因的序列比较与系统进化分析,浙江省分离的同型别毒株的基因序列同源性高于福建省与上海市的分离毒株,而浙江省同地区分离株的核苷酸同源性更高,地区接近的分离株系统进化分支的分布也大部分更靠近。汉滩型病毒(HTNV)福建株的ZH53和汉城型病毒(SEOV)浙江建德株Gou3和ZJ5与本研究同型别的其他株及国际标准株的核苷酸同源性较低,分别为82.7%~86.3%和84.0%~85.3%,而且分别在HTNV和SEOV发生群中构成一独立分支。浙江省从田鼠中分离到SEOV,产生宿主"溢出"现象。结论浙江、福建省及上海市东南沿海地区汉坦病毒的基因差异和亲缘远近关系主要表现在地区性,显示出高度的地理聚集现象,浙江省建德地区和福建省分别存在SEOV和HTNV的特殊亚型病毒。
【作者单位】： 浙江省疾病预防控制中心浙江省肾综合征出血热疫苗研究重点实验室;南京医科大学第一附属医院;温州医科大学;南京军区军事医学研究所;
【关键词】： 汉坦病毒 序列分析 系统进化 地理聚集现象 特殊亚型
【基金】：国家自然科学基金(81171609,81473036)~~
【分类号】：R373
【正文快照】： 肾综合征出血热(HFRS)是一种疫区分布广、病 析,以邻位相连法(NJ)构建系统发生树,分析东南死率较高的自然疫源性疾病。最初为汉滩型 沿海地区与其他地区汉坦病毒的基因差异。(HTN),之后又出现汉城型(SE0)疫区,目前HTN和SE0混合型大量存在[1]。我国东南沿海地区HFRS ^病例数较

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