甘肃主要绵羊品种的PRKAG3、CAST和CAPN1基因多态性与肉品质相关性分析

发布时间：2017-03-23 22:06

  本文关键词：甘肃主要绵羊品种的PRKAG3、CAST和CAPN1基因多态性与肉品质相关性分析，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：为从分子水平研究甘肃境内典型养殖模式下甘肃高山细毛羊、小尾寒羊、藏羊、蒙古羊和滩羊5个绵羊品种(各50只)PRKAG3基因、CAST基因和CAPN1基因多态性与屠宰性能和肉品质的相关性,探讨以提高绵羊屠宰性能和肉品质性能的可能性。研究采用PCR-SSCP技术对5个绵羊品种的PRKAG3,CAST以及CAPN1基因的多态性进行研究,并与9月龄屠宰性能和肉品质进行相关性分析。主要研究结果如下:1、5个绵羊品种均检测到PRKAG基因A2689G和A3659G两个多态位点。A2689G位点位于内含子4,A3659G位点位于外显子10。A2689G多态位点中滩羊的杂合度最高,甘肃高山细毛羊次之,PIC值均介于0.25~0.5之间,为中度多态。经χ2检验,藏羊偏离哈代-温伯格平衡状态,其余绵羊品种在该位点均处于哈代-温伯格平衡状态。对于A3659G多态位点,滩羊杂合度最高,为0.41,除小尾寒羊外,其余4个绵羊品种PIC值均介于0.25~0.5之间,为中度多态。关联性分析表明,A2689G多态位点对胴体重和失水率有显著影响(P0.05);A3659G多态位点对净肉率、对剪切力有显著影响。2、5个绵羊品种均检测到CAST基因扩增片段G62T,C110T多态性位点,PIC值介于0.25~0.5之间,为中度多态。哈代温伯格平衡检验5个绵羊品种均偏离哈代温伯格平衡。关联性分析表明,多态位点对失水率和剪切力有显著性影响(P0.05)。3、5个绵羊品种中均检测到CAPN1基因A630G多态位点,位于外显子6,5个绵羊品种PIC值介于0.25~0.5之间,为中度多态。关联性分析表明,此多态位点与胴体重和肉色有显著相关性(P0.05)。4、基因聚合分析表明AB-FF-AB-BB基因型组合的个体有利于失水率与肉色的提高(P0.05),AA-FF-AB-BB基因型组合的个体有利于胴体重的提高(P0.05),且对肉色评分影响显著(P0.05)。
【关键词】：绵羊 PCR-SSCP PRKAG3基因 CAST基因 CAPN1基因 肉品质性状 关联性分析
【学位授予单位】：甘肃农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S826
【目录】：

• 摘要4-5
• SUMMARY5-9
• 第一章 文献综述9-20
• 1 PRKAG3基因的研究现状9-13
• 1.1PRKAG3基因的定位与发现9-10
• 1.2 PRKAG3结构与活性调节10-11
• 1.3 PRKAG3在骨骼肌中特异性表达11-12
• 1.4 PRKAG3对营养代谢的调节作用12
• 1.5 PRKAG3基因对肉质的影响12-13
• 2 Calpain家族基因13-18
• 2.1 Calpain系统的组成13-14
• 2.2 CAPN1和CAST结构14-16
• 2.3 钙蛋白酶系统功能16-18
• 3 PCR-SSCP与SNP的研究综述18-19
• 3.1 SSCP技术的原理18
• 3.2 PCR-SSCP方法的特点18
• 3.3 SNP及其研究方法18-19
• 4 本研究的意义19-20
• 第二章 材料与方法20-28
• 1 实验材料20-22
• 1.1 主要仪器设备20-21
• 1.2 主要试剂21
• 1.3 主要试剂及配制21-22
• 2 试验方法22-25
• 2.1 技术路线22-23
• 2.2 血细胞DNA的提取23
• 2.3 引物设计23-24
• 2.4 PCR反应最佳反应体系24
• 2.5 PCR产物检测24
• 2.6 PCR-SSCP分析及基因型判定24-25
• 3 数据分析25-28
• 3.1 生物信息学数据分析25-26
• 3.2 突变位点分析26-27
• 3.3 统计分析模型27-28
• 第三章 结果与分析28-47
• 1 基因组DNA抽提结果28
• 2 基因PCR扩增结果28
• 3 PCR-SSCP多态性检测及测序对比结果28-47
• 3.1 PRKAG3基因PCR-SSCP分析及结果多态性检测28-30
• 3.2 PRKAG3群体遗传学分析30-32
• 3.3 CAST基因SSCP检测与判型32
• 3.4 CAST基因第3内含子测序结果比对32-33
• 3.5 CAST基因型频率和基因频率分析33-34
• 3.6 CAST基因基因多态位点的遗传特性34
• 3.7 CAPN1基因多态性34-35
• 3.8 基因型频率和基因频率35-36
• 3.9 基因多态位点与屠宰性状及肉品质性状分析36-44
• 3.10 对PRKAG3、CAST、CAPN1基因与肉质相关性分析44-45
• 3.11 多基因聚合分析45-46
• 3.12 多基因聚合与肉品质性状相关性分析46-47
• 第四章 讨论与结论47-53
• 1 讨论47-52
• 1.1 PRKAG3基因遗传特性分析及肉质性状的关系47-49
• 1.2 CAST基因遗传特性分析及肉质性状的关系49-50
• 1.3 CAPN1基因遗传特性分析及肉质性状的关系50-51
• 1.4 不同基因型组合对肉品质影响51-52
• 2 结论52-53
• 参考文献53-61
• 致谢61-62
• 作者简历62-63
• 导师简介63-64

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 张彩霞;吴建平;赵生国;蔡原;李天科;张娟;雷赵民;;部分肉牛类群CAPN1基因第9外显子多态性及其与肉质性状的相关性[J];西北农业学报;2014年03期

2 姜成国;全世元;曹阳;张国梁;董宝池;金海国;张立春;;CAPN1基因4685位点与肉质嫩度相关性研究[J];安徽农业科学;2013年01期

3 李梦云;余冰;陈代文;;饲粮中添加二甲双胍对猪PRKAG3基因表达量及肉质的影响[J];畜牧兽医学报;2012年10期

4 陶晓臣;刘兴亮;高爱琴;王志新;张文广;李金泉;;不同品种绵羊背最长肌PRKAG3和LPL基因的表达差异[J];中国草食动物科学;2012年S1期

5 曹阳;牛春华;张国梁;金海国;;草原红牛CAPN1基因第5外显子多态性与肉质性状的相关研究[J];吉林畜牧兽医;2009年09期

6 叶满红;文杰;;钙蛋白酶组分μ-calpain的研究进展[J];中国畜牧兽医;2008年11期

7 吴旧生;徐宁迎;;金华猪×皮特兰猪F_2的肉质及相关组织学特性与CAST和MyoG基因PCR-MspⅠ多态性的关系[J];农业生物技术学报;2008年03期

8 张增荣;朱庆;;钙蛋白酶Ⅰ(CAPN1)基因在不同鸡品系中的遗传多态性分析[J];黑龙江畜牧兽医;2008年03期

9 翟峰;张勇;朱宇旌;;钙蛋白酶系统与肌肉增长及嫩度的相关性研究[J];畜牧与兽医;2007年09期

10 张增荣;朱庆;蒋小松;杜华锐;;钙蛋白酶Ⅰ(CAPN1)基因多态性与鸡肉嫩度和屠体性状的相关研究[J];遗传;2007年08期

中国博士学位论文全文数据库 前1条

1 田万强;牛AMPK家族7个基因SNP检测及其与生长和肉质性状的关联分析[D];西北农林科技大学;2013年

中国硕士学位论文全文数据库 前5条

1 王耀武;阿勒泰羊脂肪沉积相关基因的多态性与表达研究[D];中国农业科学院;2014年

2 高海军;CAPN1基因对鸡肌肉嫩度性状的遗传效应及其表达规律研究[D];扬州大学;2010年

3 卢亚洲;绵羊PRKAG3基因的克隆表达及多态性与滩羊肉质品质的关联分析[D];中国农业科学院;2009年

4 庞瑾;猪Pit-1基因分子遗传多态性研究[D];中国农业科学院;2004年

5 孙万元;长金猪及其肉质性状候选基因的研究[D];浙江大学;2004年

  本文关键词：甘肃主要绵羊品种的PRKAG3、CAST和CAPN1基因多态性与肉品质相关性分析，，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：264657