mmu-miR-107调控Cacna2d1基因的mRNA水平
本文关键词:mmu-miR-107调控Cacna2d1基因的mRNA水平 出处:《广东医学院学报》2015年05期 论文类型:期刊论文
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【摘要】:目的生物信息学预测并实验验证mmu-miR-107的靶基因。方法利用Target Scan、miRanda、Clip-seq及miRDB预测mmu-miR-107靶基因,分别构建含有候选靶基因(Cacna2d1、Capza2、Celsr2、Csnk1g2和Tmem47)3'UTR的荧光素酶报告载体p GL3,通过双荧光素酶检测系统、时实定量PCR进一步验证预测的靶基因。结果成功构建分别含有5个候选靶基因3'UTR的荧光素酶报告载体;与mi R-NC组相比,mi R-107组共转染p GL3-Cacna2d1 3'UTR、p GL3-Cav13'UTR的荧光素酶活性均显著下降(P0.01或0.05);其余候选靶基因Capza2、Celsr2、Csnk1g2和Tmem47的共转染组荧光素酶活性差异无统计学意义(P0.05);过表达或下调C2C12细胞的miR-107,可有效降低或提高Cacna2d1的mRNA水平表达(P0.05)。结论初步验证Cacna2d1是mmu-miR-107的靶基因。
【作者单位】: 广东医学院衰老研究所;广东医学院医学检验学院;广东医学院生物化学与分子生物学研究所;广东省分子诊断重点实验室;重庆医科大学检验医学院;
【基金】:国家自然科学基金项目(No.81170327) 广东省医学科研基金(No.A2014470) 东莞市医疗卫生一般项目(No.201410515200159;2011108102031) 广东医学院科研基金项目(No.M2013002;M2010007) 广东医学院大学生创新创业训练计划项目(No.201310571009;1057113036) 广东医学院建博科技创新团队项目(No.STIF201102)
【分类号】:R3416
【正文快照】: 与细胞生物学和分子生物学研究相互补,生物信息学在推进mi RNAs研究的进程中发挥着非常重要的作用。mi RNA与靶基因m RNAs的3'UTR结合而发 挥生理功能,生物信息技术可预测受mi RNA调控的相关m RNA[1]。前期研究发现[2],mi R-107在核纤层蛋白病相关动物模型Lmna-/-与野生型小
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,本文编号:1334522
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